慢性乙型肝炎患者都希望通过治疗在短时间内HBeAg和HBV－DNA转阴。那种拨开乌云见青天的急切心情是可以理解的。但是，由阳转阴要有一个过程，而这个过程的长短，取决于感染的方式（垂直传播、水平传播、经血传播等），感染病毒量的多少，病程的长短，免疫功能的状况及治疗时有无炎症活动和炎症活动的程度以及服药时间的长短等等。临床实践证明，任何药物的疗程都需要3个月以上，甚至一年以上。原因是什么？ 
　　这里我们先谈谈典型的急性乙型肝炎患者血清中病毒标志物的转阴情况，慢性乙肝大三阳的病毒复制指标HBeAg和HBV－DNA转阴是抗病毒治疗的目的之一，但不是唯一目的。HBeAg是核心抗原成份，是临床上表达病毒复制较实用的血清标志物，其阳性说明乙肝病毒（HBV）在体内复制活跃，传染性强，其在血清中的存在时间略短于HBsAg，一般10周内消失；血清HBV－DNA是病毒复制的直接标志，其在ALT高峰后，HBeAg转阴的同时消失，所以一般也在10周内转阴；而HBsAg一般在12至16周内转阴，抗—HBs可在HBsAg消失后的1~2个月出现。由此看来，典型的急性乙型肝炎由于感染的是野生毒株，免疫系统和免疫应答也都正常，所以，HBeAg和HBV－DNA一般都可以在3个月左右转阴，大多数病人肝功能也在3个月左右复常，但肝组织病变完全恢复须在半年以后。而慢性乙型肝炎由于免疫应答功能低下，病毒感染状态复杂（常是野生毒株和变异毒株的混合感染，或为变异毒株的感染），病程较长，所以，两者转阴时间无论如何也不可能低于3个月。慢性乙肝治疗药物的用药疗程要三个月以上，或更长时间，因此治疗要有信心和耐心。